Po odzyskaniu niepodległości przez Polskę liczba prawosławnych w Aleksandrowie zmalała (w 1921 roku stanowili zaledwie 1,9% mieszkańców miasta) a stan techniczny świątyni wymagał kosztownych remontów. W 1930 roku podjęta została decyzja o rozbiórce cerkwi, symbolu władzy zaborczej. Wywołało to protesty miejscowych wiernych a także hierarchii Kościoła prawosławnego w Polsce. Rozpoczętą w 1930 r. rozbiórkę zakończono pięć lat później całkowitą likwidacją obiektu. Wyposażenie przeniesiono jednak do domu parafialnego, w którym ustanowiono kaplicę prawosławną pod wezwaniem św. Aleksandra Newskiego.